Herbert Aaron Hauptman est un mathématicien américain. Jerome Karle et lui sont colauréats du prix Nobel de chimie de 1985 pour « leurs réalisations remarquables dans la mise au point de méthodes directes de détermination des structures cristallines ».

Herbert Hauptman développa une méthode mathématique qui révolutionna le domaine de la chimie et ouvrit une nouvelle voie de recherche dans la détermination des structures moléculaires de matériaux cristallisés. Au XXIe siècle, ses méthodes, qui ont été améliorées, sont utilisées couramment pour élucider des structures complexes.